Hiện có một số ý kiến cả trên nghị trường lẫn dư luận bày tỏ lo lắng rằng, phân bón đang từ diện không chịu thuế giá trị gia tăng (GTGT), nay áp thuế GTGT 5% thì sẽ làm tăng giá, ảnh hưởng tới sản xuất nông nghiệp.